При проведении активного вентилирования большое значение имеет правильная, с наименьшими затратами эксплуатация вентиляционных установок при одновременном обеспечении необходимого технологического эффекта. Величину выдержек определяют расходы на электроэнергию, амортизационные отчисления, расходы на материалы, текущий ремонт и заработную плату обслуживающего персонала. Величина издержек по отдельным статьям на каждом предприятии различна, но в любом случае при применении переносных установок основными затратами являются расходы на электроэнергию и заработную плату, а при применении стационарных и холодильных установок - на амортизацию и электроэнергию.

Для сокращения затрат на вентилирование помимо правильного ведения технологического процесса большое значение имеет рациональная организация работ, которая позволяет уменьшить количество специальных работников (уменьшаются затраты на зарплату), и увеличить количество провентилированного зерна (снижается себестоимость вентилирования).

Издержки на вентилирование компенсируются получаемым экономическим эффектом, который зависит от целей вентилирования. В большинстве случаев он получается в результате частичного снижения влажности при вентилировании, а следовательно, и уменьшения последующих затрат на сушку за счет сокращения перемещений зерна, исключения в некоторых случаях больших затрат на специальные мероприятия по борьбе с вредителями хлебных запасов и некоторых других факторов.

При правильном вентилировании всегда сохраняется и улучшается качество зерна, что приводит к увеличению выхода конечной продукции (муки, крупы) и повышению ее сортности.

В некоторых случаях активное вентилирование зерна атмосферным или подогретым воздухом является практически единственным или наиболее эффективным способом приведения зерна в стойкое для хранения состояние и повышения его качества, например, при обработке зернобобовых культур, клещевины, семенного и самосогревающегося зерна и в некоторых других случаях.